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Carboxypeptidase B
羧肽酶B
I.U.B.: 3.4.17.2
C.A.S.: 9025-24-5
羧肽酶B(CPDB)是金属羧基肽酶,其催化从多肽的C-末端位置碱解氨基酸,赖氨酸,精氨酸和鸟氨酸的水解:
肽基-L-赖氨酸(-L-碱性氨基酸)+ H 2 O→肽+ L-赖氨酸(L-碱性氨基酸)
羧肽酶由胰腺的腺泡细胞分泌为酶原。酶在胰岛素被小肠激活。
历史:
1931年,Waldschmidt-Leitz 等 证明猪胰腺排泄物含有催化精氨酸从蛋白质释放的酶(Folk 1971)。他们称之为酶“protaminase”。在1933年,Calvery使用蛋白清蛋白来表明它也可能对这种酶敏感,表明赖氨酸和组氨酸也可以释放。在整个20世纪30年代和40年代,据信这种酶与糜蛋白酶相同(Sumner和Somers 1947和Northrop等人, 1948)。
在1940年,霍夫曼和伯格曼的工作表明赖氨酸只是在羧肽酶A(CPDA)存在下从底物缓慢释放出来。Folk在1956年的作品表明赖氨酸在市售的胰脏粉末(Folk 1971)的存在下迅速释放。这两个见解导致实验证实存在两种单独的羧肽酶(Folk 1956,Folk和Gladner 1958)。羧肽酶B名称由Folk 等人 于1960年正式将其与CPDA区分开来。
1975年,Titani 等人 确定氨基酸序列。1976年,施密德和赫里奥科特将结构解析为一个2.8Å分辨率,后来被Coll 等人完善。胰腺猪pro-CPDB前段的球状结构域是由Vendrell 等人的 NMR光谱学衍生的。在1990年。
zui近的工作包括获得CPDB的更高分辨率晶体结构(Fernández 等, 2010),以及解决有效的硫醇抑制剂的晶体结构(Adler 等, 2005)。
特异性:
CPDB由胰蛋白酶激活。CPDB对赖氨酸和精氨酸是高度特异性的,但显示出对精氨酸的偏好(Tan和Eaton 1995)。它也可以对缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸,天冬酰胺,甘氨酸和谷氨酰胺起作用(速度较慢)(Villegas等, 1995,Nishihira 等, 1995)。与CPDA中的Gly207,Ile243和Ile255相比,羧肽酶A(CPDA)和CPDB之间的特异性差异可归因于CPDB中的残基Ser205,Gly241和Asp253(Coll 等人, 1991)。
分子特征:
Clauser 等人 研究了大鼠前羧肽酶B基因,发现它与牛CPB1 基因非常相似(Clauser 等,1988)。该CPB1 基因在许多真核生物中是保守的,在人类,黑猩猩,狗,小鼠,大鼠,鸡,斑马鱼进行了研究,并果蝇(阿维莱斯和2004年本德雷利)。大鼠CPDB的成熟形式与牛CPDB(77%相同)同源,参与催化或配体结合的氨基酸显示无差异。前羧肽酶B的编码区由11个外显子组成(Clauser 等,1988)。大鼠CPDB ,大鼠CPDA 和大鼠CPDA2的比较 基因已经表明,尽管间插序列存在很大差异,但外显子的数目,位置和序列组成是保守的(Gardell 等人,1988,和Clauser 等,1988)。通过cDNA和mRNA测序,CPDB mRNA已被确定为1385个核苷酸,不包括poly(A)尾。大鼠CPDB mRNA比CPDA mRNA长100个核苷酸。这种差异主要是由于CPDB mRNA中3'非翻译区(UTR)较大(Han等,1986)。
组成:
CPDB的主要形式是单体状态。CPDB每摩尔蛋白质含有1个锌原子。配位锌残基的残基是保守的,包括两个组氨酸,谷氨酸和水(Avilés和Vendrell,2004)。
蛋白质登录号: P09955
CATH分类(v。3.2.0):
分子量:
*pH: 9.0(Wolff 等 1962)
等电点: 4.6-5.2(Lipperheide和Otto 1986)
消光系数:
活性残留物:
抑制剂:
应用:
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