Dovetail Genomics 是一家位于圣克鲁斯的初创生命科学公司,致力于开发基因组学技术,以改善基因组组装、揭示关键的结构变异信息以及基因组学中的许多其他令人兴奋的应用。
dovetailgenomics 21007说明书
反应 | 8 |
验证样本 | 哺乳动物细胞 |
技术 | Hi-C, ChIP-seq |
标签 | 仅供研究使用 |
应用程序 | 蛋白质定向染色质构象、基因调控和新型增强子和超级增强子的发现 |
Dovetail™ HiChIP MNase Kit 结合了 ChIP-seq 和 Hi-C 的优点,Hi-C 是一种邻近连接方法,使用标准的 Illumina 双端测序捕获长距离相互作用,使研究人员能够查询由特定蛋白质介导的蛋白质定向染色质构象。兴趣。
除抗体外,该试剂盒提供了在生成 NGS 文库之前对哺乳动物样本进行染色质免疫沉淀和邻近连接步骤所需的所有试剂。该试剂盒与用于 Illumina 的 Dovetail™ 文库模块(货号 #25004)和用于 Illumina 测序的第 3 方标准双端文库制备试剂盒兼容。
Dovetail HiChIP Kit 具有以下主要优势:
在单个库中同时捕获 ChIP-seq 和 Hi-C 数据
推出更多即用型抗体
以核小体水平分辨率绘制染色质相互作用图
从样品到测序就绪文库的简单三天工作流程
与其他类似方法相比,Dovetail HiChIP 工作流程具有多项优势:
染色质的酶促和均匀裂解
来自邻近结扎的远程信息的丰富
稳健性和重现性低至一百万个细胞输入
经验证的常见抗体清单
Dovetail™ Micro-C Proximity Ligation Assay 与 Dovetail HiChIP 方法的*组合使使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 能够在邻近连接之前均匀地分割染色质,没有序列偏差,消除了对精细超声处理程序的需要,并提供了染色质相互作用的最大分辨率(低至单核小体大小)。
绘制蛋白质结合位点和长程蛋白质定向相互作用
Dovetail HiChIP Kit 能够研究蛋白质导向的 3-D 染色质相互作用。与 ChIP-seq 类似,Dovetail HiChIP 数据捕获由目标蛋白质直接结合的序列。然而,还捕获了由感兴趣的蛋白质介导的其他远程相互作用。在测定中使用MNase 会产生核小体分辨率数据。
以较少的顺序生成高分辨率的接触图
蛋白质导向染色质特征的富集使高分辨率接触图生成成为可能,但读取深度更小。与基于高分辨率限制性内切酶的 Hi-C 相比,Dovetail HiChIP 数据能够以读取深度的一小部分显示高阶染色质特征,例如环和染色质相互作用,从而显着节省测序成本。
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